Значение имени Алексей » Сайт про магію та потойбічне життя людини. Сонник, Гороскоп, Хіромантія та Значення іменн.

Имя Алексей в переводе с древнегреческого языка означает «защитник», «оберегающий». Имя Алекса также является самостоятельным именем. 

Покладистый характер Алексея помогает ему счастливо строить свою семейную жизнь. Творческие способности дают широкие перспективы, но Алексей очень брезглив и поэтому отказывается от многих удачных идей. Больше всего в своей жизни Алексей ценит своего отца, следом идут дети Алексея.

 

Расшифровка имени по буквам:

 

А — экспансивность и эмоциональность
Л — находчивость, артистичность и логика
Е — изворотливость, хорошее владение языком и любознательность
К — стойкость, слабость нервов и прозорливость
С — благоразумие, капризность и властолюбие
Е — изворотливость, хорошее владение языком и любознательность
Й — приземленность и практичность

 

ЗОДИАК ИМЕНИ. Водолей.

 

ПЛАНЕТА. Нептун.

 

ЦВЕТ ИМЕНИ. Голубой, зеленоватый.

 

КАМЕНЬ-ТАЛИСМАН. Лазурит.

 

РАСТЕНИЕ. Тополь, омела, сирень.

 

ЖИВОТНОЕ. Краб.

 

ОСНОВНЫЕ ЧЕРТЫ. Развитая интуиция, воля, активность.

 

ТИП. При общении с Алексеем нужно помнить, что его тотемное животное — краб, который может атаковать клешнями, тащить свою жертву, пятиться, а если борьба неравная — зарывается в песок.

 

ИМЯ И ХАРАКТЕР. Алексей обладает ярко выраженными творческими способностями, у него покладистый характер. Это помогает ему быть счастливым в семейной жизни. Не пускается во все тяжкие он больше всего из-за врожденной брезгливости. О своих детях он заботится больше, чем о себе; при этом сохраняет некую зависимую привязанность к отцу даже до своего почтенного возраста.
Алексей с детства доброжелателен к людям. Во всех делах он очень старателен и чем бы ни занимался, стремится к совершенству. Помогает ему в этом честолюбие. Но если Алексей лишен этого качества, то частенько поддается лени и превращается в совершенно другого человека.
Это не величественный и большой, а обыкновенный, нежный и надежный человек. Правда, все его прекрасные качества как бы в тумане, выражены неярко — «красивый», «легкий» и даже округлый». Это человек, предназначенный для повседневной жизни. Страсти, взлеты, крутые повороты судьбы, неожиданные решения — не его стихия.

 

ПСИХИКА. Алексей интроверт: больше углублен в себя, убегает от действительности, прячась в песках своего подсознания. Обладает живым воображением. Часто пытается заранее оправдать свои поступки, особенно когда напуган или боится осуждения.

 

ИНТУИЦИЯ. Тонкая, женского типа.

 

ИНТЕЛЛЕКТ. Тип мышления синтетический. Любознателен, обладает хорошей памятью.

 

НРАВСТВЕННОСТЬ. Почтителен к родителям. Способен на сомнительные поступки.

 

ЗДОРОВЬЕ. Среднее, легко переутомляется. Страдает желудочными заболеваниями, поэтому должен заботиться о пищеварении. Для Алексея характерна беззащитность, если не внешняя, то внутренняя. Не исключены такие дефекты, как шепелявость, заикание, колченогость и т. п.

 

СЕКСУАЛЬНОСТЬ. В женщине особенно ценит аккуратность и опрятность. В сексуальных играх не очень искусен, но тем не менее легко одерживает победы. Чувствителен, осторожен, раним, любопытен — стремится познать все формы сексуальных связей, накопить опыт.

 

БРАК. Алексей всегда верный муж, а вот жена иногда может воспользоваться его доверчивостью. Хорошо складывается с Анастасией, Анжелой, Анной, Варварой, Галиной, Клавдией, Ларисой, Любовью, Надеждой, Светланой. Не так удачны отношения с Верой, Оксаной, Тамарой и Юлией.

 

УВЛЕЧЕНИЯ. Алексей предпочитает быть человеком дела и меньше заниматься разговорами.

 

ПОЛЕ ДЕЯТЕЛЬНОСТИ. Алексей — индивидуальность с ярко выраженными творческими способностями. Благодаря им он может добиться значительных успехов в живописи, литературе, театре, а также в точных науках.

 

БИЗНЕС. Алексей старателен в любом деле, с удовольствием делает даже однообразную работу. Он всегда стремится к совершенству и добивается больших успехов в производстве, науке, спорте, бизнесе, может достигнуть хорошего положения в обществе. Потенциальными кандидатами в удачливые предприниматели являются те Алексеи, отцов которых зовут Иванами, Михаилами, Павлами и Федорами.

 

День Агела, именины 17 февраля, 25 февраля, 28 февраля, 8 марта, 22 марта, 28 марта, 30 марта, 5 апреля, 4 мая, 7 мая, 2 июня, 5 июня, 22 июня, 23 июня, 6 июля, 17 июля, 4 августа, 20 августа, 22 августа, 25 августа, 26 августа, 27 августа, 30 августа, 4 сентября, 12 сентября, 16 сентября, 22 сентября, 25 сентября, 1 октября, 2 октября, 4 октября, 11 октября, 13 октября, 18 октября, 29 октября, 3 ноября, 6 ноября, 11 ноября, 13 ноября, 20 ноября, 22 ноября, 23 ноября, 27 ноября, 3 декабря, 5 декабря, 6 декабря, 10 декабря, 11 декабря, 17 декабря, 23 декабря.

 

Известные люди с именем Алексей

 

Алеша Попович (фольклорный собирательный образ богатыря в русском былинном эпосе. Алёша Попович как младший входит третьим по значению в богатырскую троицу вместе с Ильёй Муромцем и Добрыней Никитичем. В украинских думах также встречается персонаж Олексий Попович.)

 

Алексей Михайлович (1629 — 1676) второй русский царь из династии Романовых (1645 — 1676), сын Михаила Фёдоровича и его второй жены Евдокии

 

Алексей Пешков, известен как Максим Горький (1868 — 1936)  писатель, прозаик, драматург. Один из самых популярных авторов рубежа XIX и XX веков, прославившийся изображением романтизированного деклассированного персонажа («босяка»), автор произведений с революционной тенденцией, лично близкий социал-демократам, находившийся в оппозиции царскому режиму, Горький быстро получил мировую известность.

 

Алексей Стаханов (1905/1906 — 1977) имя при рождении — Андрей; советский шахтёр, новатор угольной промышленности, основоположник Стахановского движения, Герой Социалистического Труда (1970). Группа из забойщика Стаханова и двух крепильщиков за одну смену добыла в 14 раз больше угля, чем предписывалось на одного человека; позднее рекорд был побит ещё вдвое. Впрочем, рекордная смена была спланирована заранее (перепроверено состояние компрессоров и молотков, организован вывоз угля, проведено освещение забоя). Но, в любом случае, подобные эксперименты (проводившиеся и на других шахтах) постепенно приводили к улучшению организации труда — а значит, и к повышению общей производительности.

 

Алексей Белов (род.1951) блюзовый музыкант (электрогитара) и педагог. Основатель и бессменный лидер группы «Удачное приобретение», исполняющей блюз и рок-н-ролл. Один из ярчайших представителей блюза.

 

Алексей Григорьевич Разумовский, при рождении — Розум  — днепровский малоземельный казак, возведённый в графское достоинство, фаворит (по не подтверждённым документально сведениям, тайный супруг) императрицы Елизаветы Петровны. Старший брат Кирилла Разумовского.

 

Алексей Серебряков (род. 3 июля 1964, Москва) — советский, российский актёр театра и кино, народный артист Российской Федерации. Вместе с семьей живет в Канаде.

 

Особых увлечений у мужчины с именем Алексей нет. Его можно назвать человеком дела, если лень не взяла в нем верх. Он не лишен творческих способностей, которые могут помочь стать хорошим художником, актером, писателем. Профессии, связанные с точной наукой, также подходят Алексею. Однообразная работа не очень нравится Алексею, но старательно выполнять он будет и ее. Если у мужчины будет на то желание, то он сможет добиться успехов и в спорте, и в бизнесе, и в производстве, заработав этим себе положение в обществе.

 

⟪ Предедущая

Значение имени, происхождение, анализ имени и влияние на личную жизнь, информация о имени на namesdb.ru

Значение имени Алексей для человека, происхождение имени, судьба и характер человека с именем Алексей. Национальность, перевод и правильное написание имени Алексей. Какие цвета, обереги, планеты покровители и знаки зодиака подходят имени Алексей? Подробный анализ и описание имени Алексей вы сможете прочесть в данной статье абсолютно бесплатно.

Содержание

В имени Алексей 7 буквы. Это люди, которые придерживаются канонов. Они живут с внушенными при воспитании правилами, стараются никогда их не нарушать, для них это единственный путь, который ведет к счастью. Из-за этого они зачастую упрямы и нетерпимы, даже тогда, когда это совершенно неуместно. Скрытое значение и смысл имени Алексей можно узнать после анализа каждой буквы.

Формула для вычисления числа имени: Алексей

• Алексей. А + Л + Е + К + С + Е + Й
• 1 + 4 + 6 + 3 + 1 + 6 + 2
• Сумма — 23 Далее 2 + 3 = 5.

• А — данная буква является самой сильной и яркой буквой в латинице. Носители данной буквы в своем имени стремятся быть лидерами, часто ведут борьбу с самим собой, любят перемены. Стремятся быть на вершине комфорта в духовном и физическом плане.
• Л — имеют тонкое восприятие к прекрасному, мягкий характер, в нужный момент могут подобрать ключ к любому человеку. Артистичны и открыты, наделены творческим складом ума. Желают делиться знаниями и опытом. Все время в поиске своего истинного предназначения, не проживают жизнь бессмысленно. Могут быть самовлюблены, недовольны другими людьми.
• Е — любят самовыражаться, обмениваться опытом с окружающими людьми. Часто в конфликте это посредники. Достаточно болтливые личности, проницательны, имеют понимание о таинственном мире. Очень любят путешествовать и узнавать что-то новое, не задерживаются на одном месте надолго.
• К — выносливые и принципиальные личности, легко берутся за новое дело и получают новые умения и знания. Люди, в имени которых есть данная буква, умеют хранить секреты. Их девиз по жизни – «всё или ничего». Выносливы и имеют твердость духа. Иногда излишне конкретны и при разговоре максимально правдивы.
• С — стараются прийти к материальному достатку, руководствуются здравым смыслом. Могут быть раздражительными, падкими к власти, привередливыми. Обладают познавательностью, умением довести начатое дело до финала и прийти к истине. Знают свое истинное предназначение в жизни, могут легко приспособиться к новым обстоятельствам или спонтанным ситуациям.
• Е — любят самовыражаться, обмениваться опытом с окружающими людьми. Часто в конфликте это посредники. Достаточно болтливые личности, проницательны, имеют понимание о таинственном мире. Очень любят путешествовать и узнавать что-то новое, не задерживаются на одном месте надолго.
• Й — замкнутые люди, которым достаточно сложно найти общий язык с посторонними личностями. Внимание к мелочам – одна из черт их характера. Часто такие люди думают, что они уникальны и стараются везде себя проявить, данная идея живет в них до последнего дня.

Происхождение имени Алексей

Происхождение имени как правило связано с культурными особенностями его народа, и бытовыми условиями. Имена появлялись у определенных народов в связи с историческими условиями, и как правило носили практические применение и смысл.

В прошлом у людей бывало и по 2 личных имени, но в современном мире сейчас так не принято.

История умалчивает, когда имена получили свою отдельную группу. Если углубится в историю человечества мы узнаем, что уже во 2-3 веке до н. э. некий философ Хрисипп в своих трудах упоминал имена как отдельное явление. Люди с давних временем давали друг другу именаи и эти имена значили, как правило род деятельности людей, или подчеркивали их характерные особенности.

Сегодня люди сами могут придумать себе имя и носить его с гордостью. Есть культуры, в которых существует по два имени человека, одно из которых тайное, так как, зная истинное имя человека можно навести на него порчу, сглазить и тд. Древние же всегда считали, что имя напрямую влияет на судьбу человека, как в известной поговорке «Как корабль назовешь, так он и поплывет», имя имеет огромное значение в судьбе человека, в этой статье мы попытаемся разобрать какое именно.

На этой странице мы раскроем значение и смысл имени Алексей, а также выясним возможные перспективы и советы относительно развития человека в личной жизни и в его профессиональной деятельности.

Лев – знак зодиака. Люди под данным знаком очень творческие, любят лидировать на роботе и во всей жизни, тянутся к успеху, стараются не занимать второстепенные роли. Негативно относятся к ограничениям, требовательны к себе, придираются к внешности, поэтому уделяют уходу за собой приличное количество времени. Всегда стремятся воспроизвести на свое окружение наилучшее впечатление, любят, когда близкие их ценят. Если лев тебя помиловал, считай это большим везением. Тебя будут звать с собой на любое мероприятие, превозносить перед другими и учить правильным манерам. Ругаться со Львом гиблая затея – они очень остры на язык и в споре слов не подбирают. Зачастую это может ранить или обидеть особо ранимого собеседника. Львы — это не те люди, которые соврут, они всегда скажут правду в лицо, чётко и по делу. Данные личности являются жуткими эгоцентриками, любят, когда им делают комплименты, стараются находится в центре внимания и обожают получать подарки.

Нумерология имени Алексей поможет Вам узнать характер и отличительные качества человека с таким именем. Также можно узнать о судьбе, успехе в личной жизни и карьере, расшифровывать знаки судьбы и пробовать предсказывать будущее. В нумерологии имени Алексей присвоено число – 5. Девиз пятерок и этого имени в жизни: «Быть свободным, как птица!».

Влияние на карьеру и профессию. У таких людей с самого рождения очень много положительных качеств, которые нужны развивать, всё зависит от будущего выбора профессию. Лучшие варианты, которые предложит им присвоенное число пять это создание собственного бизнеса, который будет совпадать с увлечениями и интересами самого человека. Он должен проявлять все таланты и способности, это может быть профессия реформатора, изобретателя, фрилансера, фотографа. Также подойдут профессии, где предусмотрены длительные командировки.

Роль имени Алексей в личной жизни. Личную жизнь людей с числом 5 всегда оценивают, как предмет живого интереса и все время обсуждают в кругу знакомых и друзей. Такие люди высоко ценят свободу, не любят ограничения и всегда стараются показать свою независимость. Им всегда сложно найти идеального для себя человека, этот процесс может занять достаточно длительное время. Им нужен партнер, который всегда примет их позицию, будет доверять и легко поддаваться переменам в жизни. Пятерки хорошо сочетаются с семерками, девятками и тройками.

Планета-покровитель имени Алексей – Меркурий. Такие люди наделены изворотливым и живым умом, проявляют инициативу, любят все новое и смену обстановки. Также они плохо относятся к рутине, могут выполнять любую работу, которая горит в их руках. У них в крови присутствует стремительность, быстрота в принятии решений. Меркурий наделяет людей тягой к знаниям, самокритичности и умению критиковать окружающих, но с определенной мягкостью и в нужный момент. Если человек не достигает успеха в любом деле, он впадает в уныние. Обаяние людей данной группы помогает им заменить другие качества, которые важны в личной жизни. Они не пытают любви к домашним делам, но показывают интерес ко всем сторонам жизни. Второй половинкой могут быть представители любого типа.

В русском языке, данное имя правильно писать так: Алексей
Если мы попробуем перевести данное имя на английский язык (транслитерация), у нас получится — aleksej-3

Кричащие названия элитных домов моды были созданы точно для Вас. Вашей задачей всегда было выглядеть опрятно и превосходно, этим самым Вы подтверждаете свой статус и вес, принадлежность к определенным кругам общества. Только благодаря престижным частям гардероба Вы чувствуете себя на своем месте и сможете легко находить общий язык с окружающими, проявлять дружелюбие и поддерживать светские беседы, не беспокоясь о внешнем виде.

Больше всего Вас мотивирует независимое положение. Поэтому Вы всегда идете той дорогой, по которой раньше никто другой не шел. Если впереди никого нет, значит Вас не будут направлять и корректировать ваши действия и шаги. Следовательно, Вы никому не позволяете утверждать, что Вы не правы, а Ваше мнение ошибочно. Практически нереально сбить Вас с пути или заставить усомниться в собственных силах.

Любая критика двигает Вас вперед и заставляет принимать еще более решительные шаги. Вы никогда не перекидываете ответственность за свои поступки на других людей, Вы готовы в случае неудачи принять на себя все обвинения. Но подобный исход маловероятен из-за вашей решительности и умения действовать. Поэтому Вы вызываете в людях веру и способны вести их за собой.

Неожиданность и перемены всегда ходят за Вами по пятам, это основные факторы и двигатели Вашего развития как личности. Вы очень общительный человек, обожаете быть частью чего-то творческого и заводить множество знакомств. Именно поэтому у Вас всегда много приятелей, друзей и хороших знакомых, большое количество деловых связей и контактов. Вам нелегко даются новые знания и вершины, но именно поэтому к Вам тянется большое количество людей, с Вами никогда не соскучишься. Рутина для Вас худшее наказание, Вы очень цените свободу и независимость, так что Вам будут по душе совместный труд и общение. Темперамент и склонность к крайностям отличают Вас от других чисел.

Судьба преподносит Вам на порядок больше взлетов и падений, нежели остальным.

Вам присущи искренние чувства, трепетные и глубокие. Вы ставите отношения на первое место со свойственным Вам максимализмом и трепетно относитесь к чувствам. Любовь овладеет Вами и станет смыслом жизни, если найдете человека, который удовлетворит все ваши требования от внешнего вида, до внутреннего содержания. Остерегайтесь стремления доминировать вместе с неумением показать свои настоящие чувства, это может порой сильно осложнять отношения для вашей половинки. Вы очень влюблены, но в то же время замкнуты и холодны, Вы можете осыпать комплиментами, но сразу же приземляете и ставите на место

Падеж	Падежный вопрос	Имя
Именительный	Кто?	Алексей
Родительный	Нет Кого?	Алексея
Дательный	Рад Кому?	Алексею
Винительный	Вижу Кого?	Алексея
Творительный	Доволен Кем?	Алексеем
Предложный	О ком думаю?	Алексее

Делитесь своим мнением относительно значения данного имени, если у вас есть какая-то информация об имени, которая не указана в статье — напишите о ней в комментариях ниже, и мы вместе с вами дополним историю этого замечального имени, благодарим за ваш вклад в развитие нашего проекта!

Если Вам понравилось значение и описание имени Алексей? или у Вас есть знакомые с таким именем, опишите в комментариях — какая у них судьба, национальность и характер.

Нам очень интересно ваше мнение! Знаете ли Вы успешных или известных личностей по имени Алексей? Нам будет интересно обсудить с Вами значение имени Алексей в комментариях под этой статьей.

Специалист по биоинформатике Алексей Комиссаров о пробелах в геномных исследованиях и планах их устранения

Не так давно специалист по биоинформатике Алексей Комиссаров присоединился к коллективу лаборатории SCAMT Университета ИТМО, где проводит сборку и аннотацию сложных геномов животных и люди. В конце 2019 года исследовательская группа «Прикладная геномика», которую он возглавляет, получила грант РФФИ. Их проект будет посвящен анализу генов и белков в нервных клетках миног, которые могли бы помочь в борьбе с нейродегенеративными заболеваниями.

Сегодня вы известны своими знаниями в области биоинформатики, но ваша кандидатская диссертация, которую вы защитили в 2012 году, была посвящена молекулярной биологии. Почему вы выбрали биоинформатику?

Действительно, я защитил кандидатскую диссертацию «Организация больших тандемных повторов в геноме мыши» в области молекулярной биологии под научным руководством Ольги Подгорной в 2012 году, но так получилось, что на самом деле она была почти полностью посвящена к биоинформатике. Дело в том, что к тому моменту большинство вопросов анализа генома уже не обходилось без биоинформатики — если вы умеете программировать, многие задачи, на решение которых могли уйти недели или даже месяцы, занимают считанные часы. Вы просто программируете алгоритм и повторяете его на новых данных. В Институте цитологии было большое сообщество специалистов по биоинформатике-самоучкам, и все мы там медленно, но верно осваивали навыки программирования и анализа геномных данных.

Тема, по которой я защищал диссертацию, была тогда новой, никто особо ею раньше не занимался. Мы изучили ту часть генома, которую практически невозможно собрать, это центромеры, теломеры. Другими словами, у нас есть эти фрагменты ДНК, которым нет места в расшифровке генома, но когда мы анализируем хромосомы экспериментальными методами, мы видим, что они есть, хотя и непонятно, где именно. Я начал задаваться вопросом, что же было в той части генома, которую мы не могли собрать, так как не знали точно, где, в какой хромосоме или в какой части хромосомы находятся эти кусочки. При сборке генома такие кусочки помещаются в искусственную хромосому — Неизвестную Хромосому.

Для этой цели я написал программу, которая будет анализировать эти фрагменты, назвав ее CHRUNTA (ChrUn, от Chromosome Unknown, Tandem Analyser) — своего рода игра слов, которую я не мог не включить, всегда есть искушение поиграйте с разными прочтениями на разных языках, чтобы русские поняли шутку, а остальные подумали, что это нормальное название. С помощью этого программного обеспечения мы обнаружили множество тандемных повторов в геноме мыши, о которых раньше не знали. Однако получены не все ответы — например, мы до сих пор не знаем, за что отвечают эти фрагменты ДНК.

А эти данные нужны, например, для создания искусственной хромосомы — такие эксперименты проводятся в Японии и США. Это открывает ранее немыслимые горизонты, но сделать его стабильным пока не удалось, а именно потому, что недостаточно данных о составе таких ключевых областей, как центромеры.

Почему вы приняли решение поступать в Университет ИТМО?

После защиты диссертации я некоторое время оставался работать в Институте цитологии, затем в 2013 году Санкт-Петербург получил два мегагранта, один из них под руководством Стивена О’Брайена. С 2013 по 2018 год я работал под его руководством.

Меня привели сюда, в Университет ИТМО, мои знакомые в 2019 году. Они рассказали мне о лаборатории SCAMT, о том, что там много возможностей, молодые кадры, много студентов, много интересного происходит. Лаборатории требовался человек для анализа геномных данных пациентов с сердечно-сосудистыми заболеваниями. Это действительно одно из самых оживленных мест в Петербурге: все постоянно что-то делают.

Кроме того, мне всегда нравились междисциплинарные исследования; В моей карьере было много ответвлений: я работал в области искусственного интеллекта, машинного обучения, анализа текста, вообще как программист. Когда я впервые приехал сюда, сразу начали намечаться коллаборации с разными группами химиков.

Мне дали преимущество перед восемью магистрантами, которых мы сейчас обучаем биоинформатике. Параллельно с этим мы работаем над разными проектами: и над теми, что я начал до прихода в ИТМО, и над теми, которые начались здесь.

 

Недавно один из таких проектов получил грант РФФИ. Не могли бы вы рассказать нам больше об этом проекте?

30 декабря 2019 года мы получили сообщение о том, что выиграли грант. Проект посвящен геномике куньих. Это очень крутые животные, настоящие хищники. На YouTube можно найти ролики, где горностай играет с кошкой, а у кошки не хватает даже реактивной мощности, чтобы следить за движениями горностая.

Куньи интересны тем, что их геномы практически не секвенированы. Кошачьи, например, очень хорошо изучены, можно сказать, что исследования этой группы поделены между учеными мира, здесь довольно сложно открыть что-то новое. Но в исследованиях группы куньих остаются белые пятна.

Остановимся на таких видах, как соболь, желтозобая куница, каменная куница, колонок и вьетнамский куница. Нам будет относительно легко получить эти образцы. В первый год мы проведем исследование желтозобых куниц, животных с желто-зеленой окраской. Этот вид занесен в региональные красные списки исчезающих видов во многих местах России. Мы сотрудничаем с Алексеем Абрамовым из Института зоологии РАН и группой специалистов по цитогенетике под руководством Александра Графодатского из Института молекулярной и клеточной биологии в Новосибирске. Алексей Абрамов ездит в экспедиции, он специалист по куньим, поэтому сможет собрать образцы. В свою очередь, наши коллеги из Новосибирска являются лучшими в мире по составлению кариотипов. Именно это, кстати, и стало преимуществом нашей заявки на получение гранта.

Как будет проводиться исследование?

Мы получаем ДНК, секвенируем ее, собираем геном и аннотируем его. Что это значит? Хорошая аналогия — взять несколько изданий полного собрания сочинений Ленина, чтобы было несколько экземпляров каждого тома. Теперь разрежьте каждую страницу на части примерно по сотне букв, тщательно их перетасуйте и помните, что часть типографской краски была удалена. Потом нужно будет собрать из этих кусочков все издание и проанализировать, что там написано. Это то, что мы делаем.

Секвенирование — первый этап, это сродни вырезанию этих фрагментов и чтению их буква за буквой. Мы не можем сразу полностью прочитать геном, для этого нам и нужны маленькие фрагменты. Сегодня наилучшие результаты дает чтение небольших фрагментов от 150 до 300 нуклеотидов. Всего геном куньих содержит от 2,3 до 2,4 миллиардов нуклеотидов. Именно поэтому биоинформатика играет такую ​​роль — вручную такой объем просто не собрать. Когда все это только начиналось, когда собирались бактериальные геномы, это можно было сделать в Word или Excel за месяц. Но геном куньих требует очень хитрых алгоритмов и программ сборки.

Существуют такие методы, как PacBio и Oxford Nanopore, которые позволяют читать более крупные фрагменты. Первый намного дороже, но дает более качественный результат, второй дешевле и показания намного дольше, но возвращают больше ошибок. Однако оба метода содержат большое количество ошибок, и вам приходится много раз прогонять ДНК, чтобы избавиться от этих ошибок, и именно поэтому такие исследования очень дороги.

Другим методом считывания фрагментов ДНК является метод считывания ссылок. Под ним мы не читаем всю молекулу за один раз — только малую часть фрагментов каждой молекулы ДНК — но точно знаем, из какой молекулы взят каждый фрагмент. И это хак, который позволяет гораздо лучше секвенировать геном. В нашей работе будут представлены все три метода.

Второй этап — сборка: когда мы выбрали наши фрагменты и прочитали их, их нужно снова собрать в соответствующие тома. Но сегодня мы способны собрать их не только не в целые «книги», то есть хромосомы, но и, в лучшем случае, в отдельные главы, то есть части хромосом. Однако даже самые лучшие методы не идеальны, поэтому даже самые лучшие сборки напоминают швейцарский сыр — в нем много пробелов, состав которых оставляет желать лучшего. Последний шаг — аннотация: пытаемся найти кодирующие белок гены, повторы, регуляторные элементы.

В настоящее время главное в работе с геномикой животных — поймать животное и правильно выделить ДНК. Все последующие этапы зависят от правильного проведения процесса экстракции. Если при сборе образцов произойдет ошибка, все последующие этапы, о которых я говорил ранее, будут только накапливать количество ошибок.

Что вы хотите узнать в ходе этого исследования?

Например, по этим данным мы можем раскрыть структуру населения и восстановить его демографическую историю – какой была его численность раньше, как она менялась. Например, соболи в Сибири к середине ХХ века были почти полностью истреблены охотниками. Затем, в 19В 60-е годы животные были вновь завезены в леса, и популяция быстро увеличилась. Теперь важно выяснить, что это сделало с их геномом. Это классическая ситуация бутылочного горлышка — это значит, что у нас было большое разнообразие генов, потом популяция резко сократилась, и не все вариации ДНК остались. Затем численность населения резко возросла, и интересно посмотреть, какой след это развитие оставило на нем.

Говоря о более фундаментальных задачах, интересно определить, какие именно гены делают куньих хищниками. Как я уже упоминал, это очень быстрые, ловкие животные, которые в тех же условиях намного опаснее своих кошачьих собратьев — крайних хищников. У некоторых видов этой группы наблюдается задержка имплантации, когда оплодотворение оторвано во времени от дальнейшего развития зародыша — явление есть, но как оно происходит на уровне генома, неизвестно. Мы попытаемся пролить свет на это.

Еще одна нерешенная загадка — видообразование, а именно, почему разные виды имеют разное число хромосом. Есть много загадок, которым уже 40 лет, и никто не может найти ответ.

Над какими проектами вы сейчас работаете, кроме этого?

Очень интересный проект по геному миноги только начался. Мы работаем над ним совместно с Лабораторией биологии синапсов (Институт трансляционной биомедицины СПбГУ). Минога в Петербурге почти как корюшка, наш местный вид, рынок кишит ими в сезон. Но это также очень важный вид животных с точки зрения изучения физиологии.

Дело в том, что у него очень крупные нейроны, и на их примере очень удобно изучать строение нейронов, их общую работу. Однако ряд исследований сталкивается с ограничением, связанным с отсутствием генома речной миноги. Сейчас разработан метод, который позволяет увидеть, что транскрибируется в каждой конкретной клетке, — это метод single-cell RNA-seq. Это даст революционные данные о функционировании нервной системы в целом и ее регенерации в частности. Но для того, чтобы провести этот анализ для миног, нам нужен геном этого вида.

Эти результаты помогут нам в исследовании различных заболеваний нервной системы – от болезни Альцгеймера до механических повреждений позвоночника. Дело в том, что у людей очень много консервативных генов, общих с генами разных животных. Когда мы найдем такие консервативные соединения, мы сможем использовать животный материал для различных модельных экспериментов, чтобы не тратить впустую редкий материал, полученный от человека. Животные дают хорошие подсказки: например, кошки являются идеальной моделью для изучения иммунной системы человека, так как у них и у нас в этом плане много общего.

Кроме того, при ближайшем рассмотрении выяснилось, что у миног очень сложный геном. И это мой главный исследовательский интерес: грубо говоря, геномы, с которыми что-то не так; которые сложно собрать. Например, репродуктивные и соматические клетки миног имеют разный размер генома. Мы не совсем понимаем, как это происходит.

Мы также работаем с беспозвоночными животными. Это поистине мир чудес – куда ни глянь, там все интересно. Геномы беспозвоночных — это вызов, вы не знаете, как к ним подойти. В общем, в геномной биоинформатике сейчас много областей, где легко наткнуться на неизведанную территорию. Это трепет науки.

Например, теперь у нас есть геном моллюска, белого моллюска, которого можно найти буквально на любом рынке Европы. Размер их генома также варьируется, и мы не понимаем, почему. У них также есть материнская и отцовская митохондриальная ДНК. У человека они обычно передаются только по материнской линии, но вовлечены как отцовская, так и материнская линии. Мы также хотим начать биоинформационную работу с комарами-переносчиками различных вирусных заболеваний. Я написал о них статью, и теперь хочу вернуться к этой теме.

Существует множество вирусов, переносимых комарами, например Зика и лихорадка Денге. Теперь, когда планета нагревается, миграция видов из районов, где есть не только малярия, но и разные вирусы, упрощается. Как нам бороться с этими болезнями, если мы не до конца понимаем структуру генома комара? Ведь мы не можем и не хотим просто так убивать целые виды — это часть пищевой цепи.

В ваши планы также входит совместная работа с Мариинской больницей. Что это будет включать?

Мы начали большой проект по кардиологии. Мы активно работаем с Мариинской больницей — проводим анализ геномных и фенотипических данных. Мы пытаемся установить, какие комбинации генов и фенотипов связаны с повышенным риском различных сердечных заболеваний.

Сейчас ситуация такова, что для большинства болезней известны родственные корреляции с некоторыми генами, геномными парами и так далее. Однако ценность корреляции невелика: количество проданного мороженого может коррелировать с количеством нападений акул. Мы хотим уйти от этого и перейти к объяснению того, как это работает.

На данный момент существует разделение между последовательностями, которые мы находим в ДНК, и аннотацией. Мы хотим объединить их в одну структуру. Нам нужен результат, когда мы можем ткнуть в любую часть генома и сказать, что это место отвечает за это. В настоящее время количество этих мест оскорбительно мало даже в геноме человека, не говоря уже об остальных.

(автор Константин Крылов)

OpenSSL Command Cheatsheet. Наиболее распространенные команды openssl и их использование… | Алексей Самошкин | Мы переехали на freeCodeCamp.org/news

Когда дело доходит до задач, связанных с безопасностью, таких как генерация ключей, CSR, сертификатов, вычисление дайджестов, отладка соединений TLS и других задач, связанных с PKI и HTTPS, вы, скорее всего, в конечном итоге будете использовать инструмент OpenSSL.

OpenSSL включает в себя множество функций, охватывающих широкий спектр вариантов использования, и сложно запомнить их синтаксис для всех и довольно легко потеряться. man страницы здесь не очень полезны, поэтому часто мы просто гуглим «openssl как [использовать вариант здесь]» или ищем какую-то «шпаргалку openssl», чтобы вспомнить использование команды и посмотреть примеры.

Этот пост является моей личной коллекцией фрагментов и примеров команд openssl

, сгруппированных по вариантам использования.

Вот список вариантов использования, которые я рассмотрю:

1. Работа с ключами RSA и ECDSA
2. Создание запросов на подпись сертификата (CSR)
3. Создание сертификатов X.509
4. Проверка CSR или сертификатов
5. Расчет дайджестов сообщений и кодирования base64
6. Клиент TLS для подключения к удаленному серверу
7. Измерение времени соединения TLS и подтверждения
8. Преобразование между форматами кодирования (PEM, DER) и форматами контейнеров (PKCS12, PKCS7)
9. Список наборов шифров
10. Вручную проверить статус отзыва сертификата от ответчика OCSP

Конечно, это не полный список, но он охватывает большинство общие варианты использования и включает те, с которыми я работал. Например, я пропускаю шифрование и дешифрование или использую openssl для управления ЦС. openssl похож на вселенную. Вы никогда не знаете, где это заканчивается. 😏

В приведенных ниже командах замените [бит] на размер ключа (например, 2048, 4096, 8192).

Сгенерировать ключ RSA:
openssl genrsa -out example.key [бит]

Распечатать только открытый ключ или модуль:
openssl rsa -in example.key -pubout
openssl rsa -in example.key -noout -modulus

Распечатать текстовое представление ключа RSA:
openssl rsa -in example.key -text -noout

Сгенерировать новый ключ RSA и зашифровать с помощью парольной фразы на основе шифрования AES CBC 256:
openssl genrsa -aes256 -out example.key [бит]

Проверьте свой закрытый ключ. Если у ключа есть парольная фраза, вам будет предложено ввести ее:
openssl rsa -check -in example.key

Удалить парольную фразу из ключа:
openssl rsa -in example.key -out example.key

Зашифровать существующий закрытый ключ с помощью парольной фразы:
openssl rsa -des3 -in example.key -out example_with_pass.key

Сгенерировать ключ ECDSA. кривая должна быть заменена на: prime256v1 , secp384r1 , secp521r1 или любую другую поддерживаемую эллиптическую кривую:
openssl ecparam -genkey -name [curve] | openssl ec -out example.ec.key

Печатать текстовое представление ключа ECDSA:
openssl ec -in example.ec.key -text -noout

Список доступных кривых EC, которые поддерживает библиотека OpenSSL:
openssl ecparam -list_curves

Создать параметры DH с заданной длиной:
openssl dhparam -out dhparams.pem [bits]

In the commands below, replace [digest] with the name of the supported hash function: md5 , sha1 , sha224 , sha256 , sha384 или sha512 и т. д. Лучше избегать слабых функций вроде md5 и sha1 и придерживаться sha256 и выше.

Создайте CSR из существующего закрытого ключа.
openssl req -new -key example.key -out example.csr -[дайджест]

Создать CSR и закрытый ключ без парольной фразы в одной команде:
openssl req -nodes -newkey rsa:[bits] -keyout example.key -out example.csr

Предоставить информацию о теме CSR на командной строке, а не через интерактивную подсказку.
openssl req -nodes -newkey rsa:[bits] -keyout example.key -out example.csr -subj "/C=UA/ST=Kharkov/L=Kharkov/O=Super Secure Company/OU=IT Department/ CN=example.com"

Создать CSR из существующего сертификата и закрытого ключа:
openssl x509 -x509toreq -in cert.pem -out example.csr -signkey example.key

Создайте CSR для многодоменного сертификата SAN, предоставив файл конфигурации openssl:
openssl req -new -key пример. key -out example.csr -config req.conf

где req.conf :

 [req] 
 приглашение = нет 
 default_md = sha256 
 отличительное_имя = dn 
 req_extensions = req_ext. 5[dn3] com[req_ext] 
 subjectAltName=@alt_names[alt_names] 
 DNS.1=example.com 
 DNS.2=www.example.com 
 DNS.3=ftp.example.com 

Создать самозаверяющий сертификат и новый закрытый ключ с нуля:
openssl req -nodes -newkey rsa:2048 -keyout example.key -out example.crt -x509 -days 365

Создайте самоподписанный сертификат, используя существующий CSR и закрытый ключ:
openssl x509 -req -in example.csr -signkey example.key - out example.crt -days 365

Подпишите дочерний сертификат, используя свой собственный сертификат «CA» и его закрытый ключ. Если бы вы были компанией CA, это показывает очень наивный пример того, как вы могли бы выпускать новые сертификаты.
openssl x509 -req -in child.csr -days 365 -CA ca.crt -CAkey ca.key -set_serial 01 -out child.crt

Печать текстового представления сертификата
openssl x509 -in example.crt -text -noout

Распечатать отпечаток сертификата как md5, sha1, sha256 дайджест:
openssl x509 -in cert. pem -fingerprint -sha256 -noout

Проверить подпись CSR:
openssl req -in example.csr -verify

Проверить, что закрытый ключ соответствует сертификату и CSR:
openssl rsa -noout -modulus -in example.key | openssl sha256
openssl x509 -noout -modulus -in example.crt | openssl sha256
openssl req -noout -modulus -in example.csr | openssl sha256

Проверка сертификата, при условии, что у вас есть корневой и любые промежуточные сертификаты, настроенные как доверенные на вашем компьютере:
openssl verify example.crt

Проверка сертификата, если у вас есть промежуточная цепочка сертификатов. Корневой сертификат не входит в комплект и должен быть настроен как доверенный на вашем компьютере.
openssl verify -untrusted middle-ca-chain.pem example.crt

Проверка сертификата, если у вас есть промежуточная цепочка сертификатов и корневой сертификат, который не настроен как доверенный.
openssl verify -CAFile root.crt -untrusted middle-ca-chain.pem child.crt

Убедитесь, что сертификат, обслуживаемый удаленным сервером, распространяется на данное имя хоста. Полезно проверить, что ваш многодоменный сертификат правильно охватывает все имена хостов.
openssl s_client -verify_hostname www.example.com -connect example.com:443

Рассчитайте MD5 , SHA1 , SHA256 , SHA384 , SHA512 Digests:
Openssl DGST -[hASH_FUNCTION]

Кодирование и декодирование Base64:
cat /dev/urandom | голова -c 50 | Опенссл base64 | openssl base64 -d

Подключиться к серверу, поддерживающему TLS:
openssl s_client -connect example.com:443
openssl s_client -host example.com -port 443

Подключиться к серверу и показать полную цепочку сертификатов:
openssl s_client -showcerts -host example. com -port 443

Извлечь сертификат:
openssl s_client -connect example.com:443 2>&1 < /dev/null | sed -n '/-----BEGIN/,/-----END/p' > certificate.pem

Заменить расширение SNI (указание имени сервера) другим именем сервера. Полезно для тестирования, когда несколько безопасных сайтов размещены на одном IP-адресе:
openssl s_client -servername www.example.com -host example.com -port 443

Протестируйте соединение TLS, принудительно используя определенный набор шифров, например. ECDHE-RSA-AES128-GCM-SHA256 . Полезно проверить, может ли сервер правильно общаться с помощью разных настроенных наборов шифров, а не тех, которые он предпочитает.
openssl s_client -host example.com -port 443 -cipher ECDHE-RSA-AES128-GCM-SHA256 2>&1

Измерить время соединения SSL без/с повторным использованием сеанса:
openssl s_time -connect example.com:443 -new
openssl s_time -connect example. com:443 -reuse

Приблизительно изучить время подтверждения TCP и SSL, используя curl :
curl -kso /dev/ null -w "tcp:%{time_connect}, ssldone:%{time_appconnect}\n" https://example.com

Измерение скорости различных алгоритмов безопасности:
openssl speed rsa2048
openssl speed ecdsap256

Преобразование сертификата между форматами DER и PEM:
openssl x509 -in example.pem -outform der -out example.der
openssl x509 -in example.der -inform der -out example.pem

Объединение нескольких сертификатов в файле PKCS7 (P7B):
openssl crl2pkcs7 -nocrl -certfile child.crt -certfile ca.crt -out example.p7b

Преобразование из PKCS7 обратно в PEM. Если файл PKCS7 имеет несколько сертификатов, файл PEM будет содержать все содержащиеся в нем элементы.
openssl pkcs7 -in example.p7b -print_certs -out example.crt

Объедините файл сертификата PEM и закрытый ключ в PKCS#12 (. pfx .p12). Также вы можете добавить цепочку сертификатов в файл PKCS12.
openssl pkcs12 -export -out certificate.pfx -inkey privkey.pem -in certificate.pem -certfile ca-chain.pem

Преобразование файла PKCS#12 (.pfx .p12), содержащего закрытый ключ и сертификаты, обратно в PEM:
openssl pkcs12 -in keystore.pfx -out keystore.pem -nodes

Список доступных наборов шифров TLS, клиент openssl способен:
openssl ciphers -v

Перечислить все отдельные наборы шифров, которые описываются сокращенной строкой списка шифров OpenSSL. Это полезно, когда вы настраиваете сервер (например, Nginx) и вам нужно проверить строку ssl_ciphers .
openssl ciphers -v 'EECDH+ECDSA+AESGCM:EECDH+aRSA+SHA256:EECDH:DHE+AESGCM:DHE:!RSA!aNULL:!eNULL:!LOW:!RC4'

Это многоэтапный процесс:

1. Получить сертификат с удаленного сервера
2. Получить цепочку сертификатов промежуточного ЦС
3. Считать URI конечной точки OCSP из сертификата
4. Запросить удаленный ответчик OCSP для статуса отзыва сертификата

Сначала получить сертификат с удаленного сервера:
openssl s_client -connect example. com :443 2>&1 < /dev/null | sed -n '/-----BEGIN/,/-----END/p' > cert.pem

Вам также потребуется получить цепочку сертификатов промежуточного центра сертификации. Используйте -showcerts , чтобы отобразить полную цепочку сертификатов и вручную сохранить все промежуточные сертификаты в chain.pem файл:
openssl s_client -showcerts -host example.com -port 443

Чтение URI конечной точки OCSP из сертификат:
openssl x509 -in cert.pem -noout -ocsp_uri

Запросите у удаленного ответчика OCSP статус отзыва сертификата, используя URI из предыдущего шага (например, http://ocsp.stg-int-x1.letsencrypt. орг).
openssl ocsp -header "Host" "ocsp.stg-int-x1.letsencrypt.org" -issuer chain.pem -VAfile chain.pem -cert cert.pem -text -url http://ocsp.stg-int- x1.letsencrypt.org

Я собрал несколько ресурсов об OpenSSL, которые могут быть вам полезны.

OpenSSL Essentials: Работа с SSL-сертификатами, закрытыми ключами и CSR | DigitalOcean — https://www.